Ο ναός της Αφαίας είναι ένας από τους πιο όμορφους κλασικούς ναούς της Ελλάδας και μάλιστα από τους αρχαιότερους που έχουν διασωθεί. Βρίσκεται στην κορυφή ενός πευκόφυτου λόφου πάνω στην Αγία Μαρίνα, σε σημείο με εξαιρετική θέα. Ο πρώτος ναός (700 π.Χ) είναι αφιερωμένος στην Αφαία,θεότητα από την Κρήτη.
Ο Δωρικός ναός, που βλέπουμε σήμερα,χτίστηκε περί το 490 π.Χ από ντόπιο πωρόλιθο και αποτέλεσε μοντέλο για την κατασκευή του Παρθενώνα και άλλων ναών στη Ελλάδα, την Ασία και Νότια Ιταλία. Όταν η ατμόσφαιρα είναι καθαρή μπορεί κανείς να δει από εδώ το ναό του Ποσειδώνα στο Σούνιο και την Ακρόπολη των Αθηνών. Λένε ότι τρεις ναοί μαζί σχηματίζουν ένα ισοσκελές τρίγωνο (το ιερό τρίγωνο της αρχαιότητας).